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ctDNA微流控芯片荧光读出:LUYOR-3260RB在LAMP微孔检测中的应用

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2024 年 1 月,北京航空航天大学樊瑜波、常凌乾、王杨团队联合上海交通大学徐高连研究员在《ACS Nano》(影响因子约 18)发表 ctDNA 检测新平台研究(Wang et al., doi:10.1021/acsnano.3c07137):基于自由流动离子浓度极化(FF-ICP)的自供电微流控芯片,30 秒完成循环肿瘤 DNA 富集,芯片上集成 100 微孔 LAMP 等温扩增区,以「阳性孔数 + 孔荧光强度」双参数读出结果,检出限低至 100 拷贝/mL。本文拆解这条体系的读出环节,并说明文献同款观察工具 LUYOR-3260RB 荧光蛋白激发光源 在荧光微孔判读中的用法。

一、ctDNA 检测难在哪

ctDNA(循环肿瘤 DNA)是肿瘤细胞释放进血液循环的 DNA 片段,携带肿瘤发生与转移的关键信息,是液体活检的核心标志物。它有三个先天难点:丰度极低(仅占循环游离 DNA 总量的 0.5%-10%)、半衰期不足 2 小时、样本基质复杂(血清、尿液、粪便都带大量 PCR 抑制物)。传统检测依赖磁珠或硅胶膜提取,操作繁琐、耗时长,低丰度样本容易因投入量不足出现假阴性。

这项工作的思路是把「富集-扩增-读出」压进一张自供电芯片:富集区通过 FF-ICP 在 30 秒内把核酸从复杂基质里拉出来,经 Y 形通道送入检测区,65℃ LAMP 等温扩增后直接读荧光——采样到出结果不需要离开芯片。

二、FF-ICP:30 秒完成富集

离子浓度极化(ICP)的原理不复杂:在阳离子选择性的 Nafion 膜上施加垂直电场,带负电的核酸分子同时受到向下的电渗透力(EO)和不断增强的向上电泳力(EP),在两力平衡处被「捕获」,形成富集带。叠加水平方向驱动力后,富集的核酸被连续推进收集通道,这就是「自由流动 ICP(FF-ICP)」——分离从一次性动作变成连续流过程。

驱动水平流动的部件很巧妙:芯片里集成了一块「真空电池」,用预脱气的 PDMS 在真空通道与液体通道之间做气体交换,产生约 60 kPa 的负压拉力推动液体,全程不需要外接泵和电源。

对比项磁珠/硅胶膜提取 + PCRFF-ICP 芯片 + LAMP
富集耗时数十分钟级,多步转移30 秒内达到富集峰值
操作离心、转移、洗脱多步手工加样后芯片自驱动连续运行
富集表现商品化试剂盒基准同浓度下富集到 DNA 约为试剂盒的 5 倍,qPCR Ct 值更低
检出限受低丰度投入量限制100 拷贝/mL,灵敏度提升 100 倍
抗干扰抑制物残留影响扩增PCR 抑制剂共存时纯化与扩增表现稳定

条件优化的结果:流速 15 μL/s、电压 100 V 时富集效率取高值。在 38 例非小细胞肺癌患者血清的 EGFR 外显子 19 缺失突变检测中,低丰度样本未再因浓度不足而漏检;早期患者血清 ctDNA 含量低于中晚期患者,芯片读数能反映病程进展。尿液与粪便样本的验证也一并完成。

三、微孔 LAMP:双参数荧光读出

芯片检测区排布 100 个微孔,预封 LAMP 试剂,65℃ 等温扩增。定量设计用了双参数:统计阳性微孔的总数,同时记录每孔荧光强度,结合泊松分布模型换算浓度——10 到 1000 拷贝/μL 区间内,实测概率与理论曲线高度吻合(R² 高于 0.99)。

值得注意的是,整个平台里「看荧光」这一步是普通实验室自建门槛偏低的环节:LAMP 产物用 SYBR Green 类染料显色,激发与发射都在可见光波段,既可以用荧光读板仪读,也可以用更简单的蓝光光源直接观察。

四、荧光微孔怎么读:LUYOR-3260RB 的位置

SYBR Green 与双链 DNA 结合后,激发峰约 497nm、发射约 520nm,450nm 深蓝光落在其激发谱的有效区间。文献即采用 LUYOR-3260RB 读微孔:手持式 450nm 深蓝光激发,佩戴配套 500nm 长通观察眼镜,蓝光反射被眼镜挡掉、只让绿光透过——阳性孔发绿光、阴性孔不发光,肉眼即可判读;9 颗 3W LED 在 30cm 处形成约 150mm 光斑,对准 100 微孔阵列一次照全,手机拍摄可留档做孔间亮度比较。12V 锂电池续航 2-4 小时,现场与超净台旁都能用。

场景LUYOR-3260RB 的用法说明
微孔阵列荧光判读30cm 光斑约 150mm,罩住芯片阵列一次照全 100 微孔,孔间照度均匀,适合阳性孔计数
手持扫查与拍摄留档500nm 长通眼镜 + 手机拍摄逐行扫查微孔,固定角度与距离拍摄,做孔间亮度比较
GFP/eGFP 报告基因筛查同一台光源看转基因材料愈伤、菌落、种子与幼苗的 GFP 筛查共用,不换设备
荧光素与钙黄绿素观察450nm 激发活体或样本标记无需底物显色,直接激发观察,扩展到细胞活力与标记实验

边界也要说清:手持激发光源承担的是定性判读与半定量复核,需要严格定量(拷贝数、Ct 值)时仍以 qPCR 或荧光读板仪为准。两者是互补关系——激发光源负责快筛、复核与教学演示,定量设备负责出具报告。蓝光与紫外透射仪的波段选择、染料适配与防护细节,可参考 蓝光透射仪和紫外透射仪怎么选:470nm 切胶的染料适配与防护。

五、常被问到的几点

LAMP 荧光为什么能用 LUYOR-3260RB 看?
SYBR Green 类染料与双链 DNA 结合后激发峰约 497nm、发射约 520nm,450nm 深蓝光位于其激发谱有效区间。3260RB 的 9 颗 3W LED 激发效率足以让阳性孔在肉眼观察下与阴性孔拉开对比,配套 500nm 长通观察眼镜挡掉蓝光反射、只让绿光透过,判读界面干净。
肉眼判读和仪器读数差多少?
阳性孔绿色荧光与阴性孔无荧光的对比明显,定性判读(有/无扩增)可靠;比较孔间亮度的半定量受拍摄曝光与角度影响,建议固定手机位置与曝光参数再横向比较。严格的浓度定量交给读板仪或 qPCR。
透射仪能替代 qPCR 吗?
不能替代。LAMP 目视判读适合快筛、现场检测与教学演示;Ct 值、拷贝数等出具报告用的定量结论仍需 qPCR 或荧光读板仪。文献平台的定量靠阳性孔数的泊松统计,同样属于仪器化读出,不依赖肉眼。
这套微流控平台离临床使用还有多远?
文献完成了 38 例临床血清的方法学验证,处于原理样机阶段;从样机到常规临床检测还要经过工程化放大与注册审批。对方法学课题组而言,FF-ICP 富集 + 微孔 LAMP 的架构已经可以借鉴到自己的芯片设计中。
文献来源:Wang Z, Liu M, Lin H, et al. An Ion Concentration Polarization Microplatform for Efficient Enrichment and Analysis of ctDNA. ACS Nano, 2024, 18(4): 2872-2884. DOI: 10.1021/acsnano.3c07137
文献下载地址:https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acsnano.3c07137
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